A Associação de Pais e Encarregados de Educação dos Alunos do Externato de Penafirme tem como principal objetivo defender o direito dos Pais à educação e ensino para os filhos e à liberdade de escolha desse ensino. Compete-lhe dar apoio ativo à Direção do Externato, pela forma e na medida em que por ambos for julgado conveniente. Esta associação procura colaborar com a escola nas iniciativas que têm em vista o desenvolvimento físico, cultural, moral e cívico dos alunos e é chamado a colaborar ativamente com a Direção do Externato no estudo e procura de soluções para os problemas concretos dos alunos, designadamente educacionais, de transporte, alimentação, saúde e quaisquer outros que venham surgir.